Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms