Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Puf60Q3UEB3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms