Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms