Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbc1d2bQ3U0J8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms