Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hace1Q3U0D9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms