Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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