Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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