Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms