Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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