Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrriq1Q0P5X1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Lrriq1Q0P5X1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrriq1Q0P5X1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms