Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms