Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sox13Q04891 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox13Q04891 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox13Q04891 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox13Q04891 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox13Q04891 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox13Q04891 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Sox13Q04891 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sox13Q04891 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Sox13Q04891 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Sox13Q04891 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sox13Q04891 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sox13Q04891 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sox13Q04891 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sox13Q04891 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sox13Q04891 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sox13Q04891 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sox13Q04891 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox13Q04891 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sox13Q04891 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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