Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms