Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1sQ02789 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms