Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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NfiaQ02780 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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NfiaQ02780 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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NfiaQ02780 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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NfiaQ02780 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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NfiaQ02780 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NfiaQ02780 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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