Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms