Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
GscQ02591 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GscQ02591 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GscQ02591 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms