Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms