Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms