Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms