Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms