Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pde1bQ01065 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms