Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SeleQ00690 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms