Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx3P81067 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms