Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms