Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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