Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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