Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ube2d3P61079 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ube2d3P61079 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ube2d3P61079 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
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Ube2d3P61079 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ube2d3P61079 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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