Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia3P60469 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms