Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Setd4P58467 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Setd4P58467 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Setd4P58467 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Setd4P58467 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Setd4P58467 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Setd4P58467 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Setd4P58467 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms