Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms