Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrp1P56183 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrp1P56183 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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