Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PctpP53808 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PctpP53808 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PctpP53808 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms