Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Dbx1P52950 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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Dbx1P52950 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Dbx1P52950 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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Dbx1P52950 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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