Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpbP50405 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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