Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SftpdP50404 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SftpdP50404 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms