Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtshP49935 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtshP49935 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtshP49935 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms