Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Tmod1P49813 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmod1P49813 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmod1P49813 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmod1P49813 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmod1P49813 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmod1P49813 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Tmod1P49813 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmod1P49813 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmod1P49813 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmod1P49813 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmod1P49813 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmod1P49813 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmod1P49813 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmod1P49813 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmod1P49813 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmod1P49813 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmod1P49813 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmod1P49813 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Tmod1P49813 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Tmod1P49813 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tmod1P49813 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tmod1P49813 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tmod1P49813 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tmod1P49813 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tmod1P49813 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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