Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PtpreP49446 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PtpreP49446 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PtpreP49446 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PtpreP49446 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PtpreP49446 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PtpreP49446 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PtpreP49446 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PtpreP49446 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PtpreP49446 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtpreP49446 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtpreP49446 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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