Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms