Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms