Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd22P35329 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd22P35329 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd22P35329 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd22P35329 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd22P35329 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd22P35329 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd22P35329 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd22P35329 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd22P35329 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd22P35329 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd22P35329 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd22P35329 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd22P35329 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd22P35329 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd22P35329 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd22P35329 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd22P35329 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cd22P35329 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cd22P35329 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd22P35329 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd22P35329 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd22P35329 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd22P35329 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd22P35329 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd22P35329 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd22P35329 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd22P35329 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd22P35329 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd22P35329 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cd22P35329 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd22P35329 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd22P35329 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd22P35329 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd22P35329 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd22P35329 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd22P35329 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd22P35329 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd22P35329 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd22P35329 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd22P35329 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd22P35329 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd22P35329 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd22P35329 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd22P35329 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd22P35329 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms