Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab5cP35278 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rab5cP35278 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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