Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms