Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hoxc11P31313 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxc11P31313 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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