Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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