Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxraP28700 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxraP28700 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxraP28700 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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