Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
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Hoxd10P28359 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Hoxd10P28359 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Hoxd10P28359 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Hoxd10P28359 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Hoxd10P28359 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Hoxd10P28359 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Hoxd10P28359 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Hoxd10P28359 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Hoxd10P28359 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Hoxd10P28359 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Hoxd10P28359 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd10P28359 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms