Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa2P28309 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms