Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms